入門編

【MD 入門 Part.1】分子動力学法とは?MDの仕組みをやさしく解説
分子動力学法(MD)の基本を初学者向けに解説します。原子をどう動かしているのか、何を計算しているのか、実際のMD計算と結びつけながら整理します。

【MD 入門 Part.2】MDで何が分かるのか?分子動力学法で見える情報を整理
分子動力学法(MD)で何が分かるのかを初学者向けに整理します。構造、運動、熱力学量、輸送特性など、MDで得られる代表的な情報を実例ベースで解説します。

【MD 入門 Part.3】MDで分からないことは何か?分子動力学法の限界と注意点を整理
分子動力学法(MD)で分からないこと、言い切れないことを初学者向けに整理します。時間スケール、サイズ効果、力場依存性、古典MDの限界などを分かりやすく解説します。

【MD 入門編 Part.4】量子化学計算とMD計算の違いとは?分子シミュレーションの2つの見方を整理
量子化学計算とMD計算の違いを、何を計算しているのか、何が分かるのか、どう使い分けるのかという観点から整理します。
理論編

【MD 理論 Part.1】力場とは何か?ポテンシャルエネルギーとの関係を整理
MD計算でよく出てくる「力場」とは何かを整理します。ポテンシャルとの違い、原子の配置とポテンシャルエネルギーの関係、MD計算でどこに効いてくるのかをやさしく解説します。